L’électrophorèse 2D permet de séparer et quantifier les protéines entières, contrairement aux approches bottom-up par LC-MS/MS dans lesquelles les protéines sont digérées en peptides.
L’électrophorèse 2D permet de séparer et détecter spécifiquement les différentes isoformes d’une même protéine porteuse de modifications ayant un impact sur sa masse ou sa charge globale (cas des phosphorylations par exemple). Les différentes isoformes peuvent ensuite être caractérisées par spectrométrie de masse.
NB : Cette technique nécessite l’utilisation d’un tampon spécifique. Veuillez nous contacter avant de préparer vos extraits protéiques.
Étapes de la prestation d'électrophorèse 2D
- Marquage des extraits (Cy2, Cy3 et Cy5)
- Séparation bidimensionnelle
- Scan des gels
- Analyse d’images
Livrables
- Liste de spots variants
- Images
En pratique : n’hésitez pas à nous contacter pour en savoir plus à medecine-p3s@sorbonne-universite.fr ou au 01.40.77.81.32